Pomysł zbudowania placówki przedstawiającej losy Polski z lat 1939 – 1945 padł już w roku 2007. Jako jej siedzibę wybrano miejsce, w którym rozpoczęła się smutna dla całego prawie świata historia okresu wojennego – miasto Gdańsk. Niespełna 10 lat później Muzeum II Wojny Światowej zostało otwarte dla odwiedzających.